女性下生殖道为开放性腔道，是人体内重要微生态区，正常情况下是以乳杆菌等优势菌为主组成的微生态动态平衡系统。阴道微生态是一个非常灵敏的系统，在受到内源性和外源性因素影响时，很容易发生改变。
两侧大阴唇自然合拢，遮掩阴道口及尿道口；阴道口闭合，阴道前后壁紧贴；女性阴道壁由完整的复层的鳞状上皮细胞构成,它们能随着体内雌激素水平的上升而不断增殖、加厚，也随内分泌周期的变化而周期性脱落。
阴道内没有发现分泌性腺体,但分泌物可来自前庭大腺、尿道旁腺、子宫颈黏液、子宫内膜和输卵管等部位。健康女性阴道分泌物是酸性的，宫颈黏液栓是碱性的。这些解剖生理特点形成了自然的防御功能。
阴道内环境
阴道内正常存在的乳杆菌对维持阴道正常菌群起着关键的作用。阴道鳞状上皮细胞内的糖原经乳杆菌的作用，分解成乳酸。使阴道的局部形成弱酸性环境(pH ≤4.5 ,多在3.8～4.4之间) ,可以抑制其他寄生菌的过度生长。
在阴道内大量乳杆菌的存在会消耗大量的糖原，使其他微生物的营养减少，生长受抑制。大量乳杆菌形成的菌膜可保护宿主的阴道壁，使其不受其他微生物的侵害。
F61妇幼社区提醒，阴道冲洗、性交等行为都可以造成阴道黏膜轻微的破损、酸碱度改变以及细胞因子被稀释等，从而破坏了阴道的屏障作用。
